Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms