Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RAB19A4D1S5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms