Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms