Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
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