Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TMEM30AQ9NV96 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms