Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms