Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AMBRA1Q9C0C7 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AMBRA1Q9C0C7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AMBRA1Q9C0C7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AMBRA1Q9C0C7 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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AMBRA1Q9C0C7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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AMBRA1Q9C0C7 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AMBRA1Q9C0C7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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