Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA4-204ENST00000618834 10557 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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MAP1LC3CQ9BXW4 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MAP1LC3CQ9BXW4 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MAP1LC3CQ9BXW4 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MAP1LC3CQ9BXW4 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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