Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHP1Q99653 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms