Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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