Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms