Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FRMPD4Q14CM0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FRMPD4Q14CM0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms