Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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COL4A6Q14031 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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COL4A6Q14031 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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COL4A6Q14031 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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COL4A6Q14031 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
COL4A6Q14031 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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