Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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