Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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