Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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