Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PPP3CAQ08209 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPP3CAQ08209 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms