Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms