Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms