Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP3M2P53677 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms