Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACADSBP45954 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms