Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MMP13P45452 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP13P45452 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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MMP13P45452 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MMP13P45452 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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