Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMPOP42166 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMPOP42166 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMPOP42166 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms