Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H1P32780 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H1P32780 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms