Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC026884.1-201ENST00000418296 457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLD1P28340 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms