Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NFKB1P19838 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms