Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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