Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPN1P18031 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms