Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCP1P17987 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCP1P17987 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms