Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLA1P09884 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLA1P09884 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLA1P09884 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLA1P09884 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms