Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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