Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms