Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLKQ9UBT6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLKQ9UBT6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms