Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms