Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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SPOCK3Q9BQ16 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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