Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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