Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HERC6Q8IVU3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HERC6Q8IVU3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HERC6Q8IVU3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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HERC6Q8IVU3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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