Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PLD3Q8IV08 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PLD3Q8IV08 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms