Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LINC01545Q5VT33 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LINC01545Q5VT33 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LINC01545Q5VT33 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LINC01545Q5VT33 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01545Q5VT33 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LINC01545Q5VT33 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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