Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AL138902.1-201ENST00000437965 856 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 TSEN15P3-201ENST00000422363 367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CEP350Q5VT06 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms