Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VWC2Q2TAL6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms