Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TAF1AQ15573 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TAF1AQ15573 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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