Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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