Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL4BQ13620 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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