Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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