Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms