Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FOXF1Q12946 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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