Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PTPRJQ12913 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
PTPRJQ12913 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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