Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
E2F1Q01094 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms