Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
FAM3AP98173 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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FAM3AP98173 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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